У ФШ насколько я знаю немного другой алгоритм, а у Геликона как раз рассчитанный на серию последовательных снимков и работает он намного быстрее.
К стати у Андрея есть хорошее видео где он рассказывает о съемки и сшивке.
Попробуйте описанный мной алгоритм, по нему как раз и будут получатся срезы резкости двигающиеся к дальнему краю. И не надо гонять туда сюда фотоапарат по рельсам, просто методично в одном направлении. (Плоскости-срезы резкости получаются относительно камеры, а не объекта. Например одна нога параллельна плоскости матрицы она может целиком попасть в полосу резкости, а вторая чуть под углом, незаметным, она уже не будет в резкости. Она уже будет частями попадать в полосу резкости, для этого и делают серию снимков с последовательным смещением полосы резкости (камеры по рельсам) чтобы полоса резкости прошла по всей ноге.) И да это делается не на автофокусе, фокусируетесь вы за счет движения рельса, так что объектив ставите в М.
Хотя конечно это Ваше дело слушать или нет, в любом случае это придет только с опытом.
Не обязательно, но желательно. Насекомое может сдвинуться, так выход из фокуса в конце менее критичен, чем в начале (выход из фокуса хвоста не так заметен, как глаз). Сшивать тоже лучше с головы (определяет что будет фоновой картинкой), но в большинстве программ порядок легко меняется.